El laboratorio se dedica a estudio de diversos procesos variables en el océano o sistemas acuáticos que canalizan gran parte de los flujos de materia (carbono, nitrógeno, oxígeno). Una segunda línea de investigación se relaciona con reciclaje de gases de efecto invernadero como el óxido nitroso, metano y dióxido de carbono y por ello el laboratorio se dedica a su medición de esos gases asi como nutrientes y materia orgánica disuelta. La sección de biogeoquímica isotópica tiene como objetivo el estudio de procesos naturales en el océano a través de comportamiento y destino de los isótopos en los medios naturales. Los isótopos de carbono y nitrógeno y la razón isotópica, son usados para entender los procesos (vías de transformación), la tasa (velocidades de la reacción y los orígenes (precursores) de las reacciones y procesos de interés en el océano, en particular producción autotrófica (foto y quimiotrófica) y respiración; en particular nos interesa procesos que trancaren en zonas deficientes de oxígeno como nitrificacion y desnitrificación).